天麻有性繁殖，即种子繁殖。这是防止天麻退化的主要途径之一。天麻种子微小，无
胚乳仅由原胚细胞组成。它的萌发靠小菇属(Mycena)一类真菌菌丝侵染种胚提供营养，我们统称促进天麻种子萌发的这类真菌为天麻种子萌发菌。
萌发菌的种类：到目前为止，文献报疲乏的天麻种子萌发菌均属于小菇属(Mycena)的真菌，主要包括国内新记录种紫萁小菇(Mosmundicola)，3种新种分别为(Morchicola)、石斛小菇(Mdendrobii)和开唇小菇(Manoectochila)。上述天麻种子萌发菌已在室内、室外及有关天麻产推广生产，从近年对天麻种子发芽率及天麻产量影响的试验结果分析，以紫箕小菇伴播天麻种子发芽率了高，天麻民最高。目前，已广泛推广使用，石斛小菇也已进入实验推广阶段。
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