臭氧作为气体杀菌剂，依靠其氧化性产生对病毒，细菌及霉菌等微生物的较强杀灭作用。同任何消毒剂一样，对动物与人造成一定的生理反应甚至损害，但臭氧比常用消毒剂要小的多，防保也容易得多，所以利用臭氧杀菌消毒的方式慢慢被越来越多的工业或者企业所接受。
臭氧能够有效杀死包括藻类在内的微生物，因为它具有强大的氧化能力，可以杀灭细胞膜。臭氧还能够灭活某些浮游动物，包括某些移动生物。采用臭氧氧化设备不仅可以有效地去除水中的有机物，而且反应速度快，设备体积小。尤其是水中含有酚类化合物时，臭氧处理可以去除酚所产生的恶臭。此外，臭氧还是一种有效的消毒剂，杀菌效果好、速度快，而且对消灭病毒也很有效。
在水处置实际中藻类问题广泛存在，藻类含量高会影响混凝和积淀，增长混凝剂量；梗塞滤池，收缩滤池过滤周期；致臭并发生藻毒素，和氯感化构成氯化消毒副产品，低落饮用水平安性。在水处置中使用臭氧产生器便可以处理这些问题。
臭氧发生器处置感化之一是溶裂藻细胞，二是杀藻，使**的藻类易于被后续工艺去除。臭氧产生器可作为除藻的一种预处置法子，它和通例处置及别的技能共同使用是处置富养分化水源水藻类问题的使用方法之一。藻毒素正成为藻类净化问题的另外一重点，在必要的前提下臭氧产生器可有效去除某些藻毒素，去除率取决于臭氧产生器投加量，其次取决于原水水质(藻毒素范例、有机物性子及浓度、碱度等)。
在使用臭氧发生器测试结果表明，操纵臭氧产生器处置百度30分钟含40－50万个/ml单胞藻及原活泼物的海水后，再用显微镜察看发现其所有的原活泼动物呈爆炸性**，把颠末水处置臭氧产生器处置的海水继承培育两个礼拜今后查验测试仍未发现任何生物，且水质清彻通明，取赤潮海水进行30分钟臭氧处置后赤色赤潮海水被氧化变成红色通明，水中夜光虫全数被杀死且呈破坏状。
