多年生草本，株高70~150厘米。鳞茎球形，淡白色，先端常开放如莲座状，由多数肉质肥厚、卵匙形的鳞片聚合而成。
根分为肉质根和纤维状根两类。
肉质根称为“下盘根”，多达几十条，分布在45~50厘米深的土层中，吸收水分能力强，隔年不枯死。纤维状根称“上盘根”，“不定根”，发生较迟，在地上茎抽生15天左右、苗高10厘米以上时开始发生。
形状纤细，数目多达180条，分布在土壤表层，有固定和支持地上茎的作用，亦有吸收养分的作用。每年与茎干同时枯死。有鳞茎和地上茎之分。
茎直立，圆柱形，常有紫色斑点，**，绿色。有的品种（如卷丹、沙紫百合）在地上茎的腋叶间能产生“珠芽”；有的在茎入土部分，茎节上可长出“籽球”。
