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细胞质基质担负着一系列重要的功能。目前了解做多的是许多中间代谢过程都在细胞质基质中进行,如糖酸解过程、鳞酸戊糖途径、糖原的合成与部分分解过程等等。蛋白质的合成与脂肪酸的合成也在细胞质基质中进行。尽管人们对些代谢反应的具体生化步骤早已比较清楚,但对它们在细胞质基质中进行反应的细节,特别是反应的底物和产物如何定向转运的机制还了解得不多。细胞信号转导是细胞代谢及细胞增殖、分化、衰老和凋亡的基本调控途径。多种信号通路如何在细胞质中形成信号网络及各条通路中信号分子交谈知之甚少。
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生物的基本能量来源的太阳光的辐射能,但生物体不能直接利用太阳光的辐射能,装片,必须先使之转换为化学能,再为生物利用。这种能量的转换是在植物细胞的叶绿体和蓝藻的光合片层中进行的。叶绿体通过光合作用把光能转换为化学能,并珠村鱼糖类、脂肪和蛋白质等大分子有机物中,而不具叶绿体的动物细胞则以植物合成的有机物为营养,通过分解代谢取得能量。线粒体是一种高效的将有机物转换为细胞生命活动的直接能源ATP的细胞器。
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